El Sistema de Gestión Integral (SGI) de CORNARE lo constituyen los modelos de gestión: Sistema de Gestión de la Calidad (SGC),  Normas ISO9001:2008 y NTCGP1000:2004; Sistema de Control interno (SCI), Norma MECI1000:2005; Sistema de Gestión Ambiental (SGA), Norma ISO 14001:2004 y el Sistema de Gestión en Seguridad y Salud Ocupacional (S&SO), Norma NTC-OHSAS 18001:2007.

Estos modelos contienen elementos comunes que al ser aplicados de manera organizada e interrelacionada, posibilitan la generación de una cultura organizacional para una gestión eficiente, eficaz y efectiva de la Corporación desde su direccionamiento estratégico y el desarrollo de sus procesos, para el cumplimiento de los objetivos constitucionales y legales vigentes, la satisfacción de las necesidades, expectativas y requisitos de los clientes y grupos de interés, así como la prevención de la contaminación y la  optimización de las condiciones de seguridad y salud ocupacional de los funcionarios.

En este sentido, el SGI encamina a la Corporación hacia su mejoramiento continuo y a mantener su posicionamiento a la vanguardia de las entidades del SINA; el SGC y el SCI integran todos los aspectos de nuestra Entidad, ya que la calidad y el control deben estar presentes en todas las dependencias y procesos; a su vez el SGA, proporciona un conjunto de herramientas, que facilitan su integración con el entorno social, que permiten  minimizar el impacto ambiental de sus actividades, promoviendo cambios de hábitos donde calidad y ambiente es responsabilidad integral de sus funcionarios y contratistas. Por ultimo, el Sistema de Gestión de Seguridad y Salud Ocupacional,  da respuesta a los requerimientos que los funcionarios tienen en su lugar de trabajo, garantizándole unas condiciones de trabajo dignas y seguras, que permitan la prevención y control de las condiciones y factores que puedan afectar su salud y seguridad,  y potenciando su desarrollo profesional y humano.

La implementación, mantenimiento y mejoramiento del SGI de CORNARE es el resultado de su compromiso con el Oriente Antioqueño para su consolidación como una región Desarrollada y Limpia, cuyos logros serán medidos en términos de la satisfacción social en la prestación de los servicios que de acuerdo con su Misión le corresponden.