Su implementación en la Corporación con base en el Modelo Estándar de Control Interno (MECI 1000:2005), surge de una  exigencia legal, la Ley 87 de 1993 por la cual se establecen normas para el ejercicio del control interno en las entidades y organismos del estado. Permite el diseño, desarrollo y operación de un Sistema de Control Interno con el fin de orientarla hacia el cumplimiento de los objetivos institucionales y la contribución de estos a los fines esenciales del Estado.

Está integrado por el esquema de organización y el conjunto de los planes, métodos, principios, normas, procedimientos y mecanismos de verificación y evaluación adoptados por la Corporación con el fin de procurar que todos los procesos y actuaciones, así como la administración de la información y los recursos se realicen de acuerdo con las normas constitucionales y legales vigentes, dentro de las políticas trazadas por la Dirección y en atención a las metas u objetivos previstos.